Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms