Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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