Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
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