Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
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