Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms