Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C2orf54Q08AI8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms