Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CD300CQ08708 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms