Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms