Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms