Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms