Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms