Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BEX3Q00994 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms