Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms