Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms