Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARF6P62330 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF6P62330 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF6P62330 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF6P62330 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF6P62330 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms