Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms