Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2MP61081 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms