Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms