Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms