Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms