Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME1P48163 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME1P48163 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME1P48163 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME1P48163 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms