Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPOP42166 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPOP42166 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPOP42166 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPOP42166 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPOP42166 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPOP42166 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPOP42166 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPOP42166 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPOP42166 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPOP42166 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPOP42166 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPOP42166 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPOP42166 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPOP42166 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPOP42166 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPOP42166 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPOP42166 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPOP42166 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPOP42166 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPOP42166 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPOP42166 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPOP42166 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMPOP42166 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMPOP42166 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPOP42166 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPOP42166 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPOP42166 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPOP42166 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPOP42166 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPOP42166 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPOP42166 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPOP42166 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPOP42166 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPOP42166 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPOP42166 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPOP42166 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms