Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF4P23510 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms