Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCEA1P23193 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms