Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms