Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC3P19447 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms