Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR1P18146 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR1P18146 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR1P18146 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms