Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF4P18085 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF4P18085 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF4P18085 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ARF4P18085 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARF4P18085 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ARF4P18085 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ARF4P18085 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARF4P18085 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF4P18085 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms