Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms