Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG2P13521 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG2P13521 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG2P13521 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG2P13521 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG2P13521 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG2P13521 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG2P13521 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG2P13521 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG2P13521 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG2P13521 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG2P13521 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG2P13521 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG2P13521 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG2P13521 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG2P13521 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG2P13521 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG2P13521 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG2P13521 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG2P13521 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG2P13521 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG2P13521 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG2P13521 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCG2P13521 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms