Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms