Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms