Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L5P0DN76 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L5P0DN76 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms