Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms