Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPBP07199 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPBP07199 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPBP07199 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPBP07199 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPBP07199 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPBP07199 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPBP07199 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPBP07199 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPBP07199 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPBP07199 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPBP07199 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPBP07199 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPBP07199 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPBP07199 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPBP07199 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPBP07199 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPBP07199 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPBP07199 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPBP07199 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPBP07199 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPBP07199 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPBP07199 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPBP07199 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPBP07199 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPBP07199 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CENPBP07199 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CENPBP07199 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CENPBP07199 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CENPBP07199 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CENPBP07199 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPBP07199 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPBP07199 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms