Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms