Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCCAP05165 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCCAP05165 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCCAP05165 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCAP05165 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCAP05165 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCAP05165 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCCAP05165 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCCAP05165 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCCAP05165 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCCAP05165 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCCAP05165 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCAP05165 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCAP05165 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCAP05165 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCAP05165 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCAP05165 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCAP05165 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCAP05165 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCAP05165 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCAP05165 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCAP05165 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCAP05165 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCAP05165 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCAP05165 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCAP05165 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCAP05165 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms