Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA3O96018 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA3O96018 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA3O96018 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA3O96018 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA3O96018 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA3O96018 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA3O96018 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA3O96018 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA3O96018 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA3O96018 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA3O96018 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA3O96018 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA3O96018 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA3O96018 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA3O96018 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA3O96018 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA3O96018 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA3O96018 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA3O96018 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA3O96018 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA3O96018 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA3O96018 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA3O96018 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA3O96018 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA3O96018 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA3O96018 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA3O96018 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA3O96018 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA3O96018 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA3O96018 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA3O96018 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA3O96018 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA3O96018 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA3O96018 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA3O96018 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms