Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNTO95613 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNTO95613 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNTO95613 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNTO95613 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCNTO95613 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCNTO95613 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCNTO95613 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCNTO95613 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCNTO95613 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNTO95613 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNTO95613 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNTO95613 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNTO95613 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNTO95613 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNTO95613 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNTO95613 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNTO95613 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms