Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms