Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms