Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP19O94966 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP19O94966 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP19O94966 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP19O94966 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP19O94966 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP19O94966 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP19O94966 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP19O94966 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP19O94966 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP19O94966 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP19O94966 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP19O94966 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP19O94966 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP19O94966 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP19O94966 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP19O94966 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP19O94966 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP19O94966 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP19O94966 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP19O94966 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP19O94966 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP19O94966 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP19O94966 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP19O94966 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP19O94966 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP19O94966 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP19O94966 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP19O94966 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP19O94966 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP19O94966 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP19O94966 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP19O94966 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP19O94966 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP19O94966 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP19O94966 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP19O94966 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP19O94966 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP19O94966 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP19O94966 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP19O94966 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP19O94966 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP19O94966 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP19O94966 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP19O94966 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP19O94966 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP19O94966 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP19O94966 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP19O94966 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP19O94966 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms