Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFL1O94874 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFL1O94874 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFL1O94874 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFL1O94874 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFL1O94874 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFL1O94874 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFL1O94874 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFL1O94874 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFL1O94874 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFL1O94874 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFL1O94874 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UFL1O94874 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFL1O94874 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFL1O94874 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFL1O94874 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UFL1O94874 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UFL1O94874 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UFL1O94874 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UFL1O94874 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UFL1O94874 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UFL1O94874 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFL1O94874 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFL1O94874 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UFL1O94874 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UFL1O94874 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UFL1O94874 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UFL1O94874 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UFL1O94874 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms