Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOX1O75936 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBOX1O75936 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms