Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF6O75683 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SURF6O75683 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SURF6O75683 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SURF6O75683 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF6O75683 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF6O75683 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF6O75683 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF6O75683 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF6O75683 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF6O75683 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF6O75683 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF6O75683 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF6O75683 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF6O75683 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF6O75683 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF6O75683 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF6O75683 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms