Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms