Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBNO60934 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBNO60934 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBNO60934 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBNO60934 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBNO60934 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBNO60934 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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