Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSVO60911 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSVO60911 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSVO60911 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSVO60911 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTSVO60911 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms