Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms