Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms